肛肠外科成立于2009年9月，主要开展肛周疾病及结直肠疾病的诊治。在痔疮的微创、微痛治疗方面及结直肠肿瘤治疗方面处于我县龙头地位。

主要诊疗项目：1.专攻肛门部疾病(如内痔、外痔、混合痔、肛瘘、肛裂、肛门直肠肿瘤、肛周脓肿、肛门直肠损伤、直肠脱垂、直肠前突、大便失禁、便秘、肛门直肠狭窄、直肠阴道瘘、肛门尖锐湿疣、炎症性肠病等)的诊治和临床研究，积累了丰富的临床经验。2.开展肠镜检查及治疗。3.与健康管理中心合作，开展乙状结肠镜检查。4.淳安县肠癌筛查工作。