呼吸内科2011年独立建科，已成为淳安县呼吸病学的临床、教学、科研中心。目前拥有主任医师1人，主治医师5人，住院医师1人。硕士1名。同时配备一支技术精湛、服务优质的护理团队。     

科室设置呼吸内科门诊、肺结节联合门诊、戒烟门诊，年门诊量近2万人。设有肺功能室、门诊雾化室、支气管镜室、睡眠监测室。

科室诊治范围覆盖慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘、肺部肿瘤、支气管扩张、慢性咳嗽、睡眠呼吸暂停等常见病及呼吸衰竭、重症肺炎、脓毒血症等危重症的抢救和诊治，率先在本县开设呼吸重症病房。

科室能够开展支气管镜常规检查、支气管镜下肺活检术、肺泡灌洗术以及支气管镜下针吸组织活检术、超声小探头引导支气管镜下活检术、无创机械通气、肺功能、睡眠监测等诊疗技术，开展肺癌规范化个体化治疗。

科室有浙江省自然科学基金基础公益研究课题1项（已结题），浙江省医药卫生科研项目2项（在研）。